Nguyên nhân dẫn đến thảm kịch của tàu ngầm Indonesia có thể là do đã xảy lỗi trong quá trình vận hành hoặc thậm chí là sai lầm nghiêm trọng trong công tác bảo dưỡng tại cảng.
Trong cuộc họp báo gần đây, Tham mưu trưởng Hải quân Yudo Margono đã tuyên bố loại trừ 1 nguyên nhân có thể gây ra thảm họa tàu ngầm.
Theo chỉ huy Hải quân Indonesia, tàu ngầm KRI Nanggala 402 cùng 53 thành viên thủy thủ đoàn có thể đã từ từ bị phá hoại bởi áp lực nước.
Tháng 5/1968, tàu ngầm tấn công hạt nhân USS Scorpion của Hải quân Mỹ được điều động đi thực hiện một nhiệm vụ hết sức quan trọng: do thám năng lực của Hải quân Liên Xô.
